解析：安徽公务员考试关于蜜蜂和熊蜂的逻辑判断题

**步：找出论点和论据。

论点：相比普通蜜蜂，农田利用方式的改变对熊蜂的生存威胁更大。

论据：由于密集管理型农业系统的推广，熊蜂在这些地方开始衰落，有的种类已经灭绝，相对而言，普通蜜蜂的数量并没有明显减少。

论点和论据都在讨论熊蜂生存情况和农田利用方式的关系，话题一致，加强优先考虑补充论据。

第二步：逐一分析选项。

A项：该项讨论蜜蜂和熊蜂的采食方式，与题干论点讨论的话题无关，无法加强，排除;

B项：该项讨论蜜蜂和熊蜂储存食物的习惯不同，出现食物短缺时熊蜂更容易受到影响，但农田利用方式的改变是否会出现食物短缺情况文段并未提及，与题干论点讨论的话题无关，无法加强，排除;

C项：该项讨论熊蜂因基因分异度降低更易受到寄生虫感染，但农田利用方式的改变是否会有寄生虫感染的风险文段并未提及，与题干论点讨论的话题无关，无法加强，排除;

D项：该项指出密集型农田对熊蜂影响更大，熊蜂无法远距离飞行而岌岌可危，解释农田利用方式的改变为什么更能威胁熊蜂的生存，解释原因，可以加强，当选。

故正确答案为D。